Isi
- Apa Genotipe dan Fenotipe itu?
- Menjelaskan Genotipe HIV
- Menjelaskan Phenoytyping HIV
- Kapan Tes Resistensi Genetik Dilakukan?
Ketika kegagalan pengobatan benar-benar terjadi, kombinasi obat alternatif harus dipilih untuk menekan populasi baru virus yang resistan ini. Pengujian ketahanan genetik membantu memfasilitasi hal ini dengan mengidentifikasi jenis mutasi yang resisten dalam "kumpulan virus" seseorang, sambil memastikan seberapa rentan virus tersebut terhadap kemungkinan agen antiretroviral.
Dua alat utama digunakan untuk tes resistansi genetik pada HIV: Tes genotipe HIV dan Uji fenotipik HIV.
Apa Genotipe dan Fenotipe itu?
Menurut definisi, genotipe hanyalah susunan genetik suatu organisme, sedangkan fenotipe adalah karakteristik atau sifat yang dapat diamati dari organisme itu.
Tes genotipe (atau genotipe) berfungsi dengan mengidentifikasi instruksi yang diwariskan dalam kode genetik sel, atau DNA. Pengujian fenotipik (atau fenotipe) mengkonfirmasi ekspresi instruksi tersebut di bawah pengaruh kondisi lingkungan yang berbeda.
Sementara hubungan antara genotipe dan fenotipe tidak mutlak, genotipe seringkali dapat menjadi prediksi fenotipe, terutama ketika perubahan dalam kode genetik memberikan perubahan yang diharapkan pada sifat atau karakteristik-seperti dalam kasus pengembangan resistensi obat.
Fenotipe, di sisi lain, menegaskan "di sini-dan-sekarang". Ini bertujuan untuk menilai reaksi organisme terhadap perubahan spesifik dalam tekanan lingkungan - seperti saat HIV terpajan pada obat dan / atau konsentrasi obat yang berbeda.
Menjelaskan Genotipe HIV
Genotipe HIV umumnya merupakan teknologi yang paling umum digunakan untuk tes resistansi. Tujuan dari pengujian ini adalah untuk mendeteksi mutasi genetik spesifik di gag-pol wilayah virus ' genom (atau kode genetik). Ini adalah wilayah di mana enzim reverse transcriptase, protease dan integrase - target sebagian besar obat antiretroviral - dikodekan pada rantai DNA.
Dengan terlebih dahulu memperkuat genom HIV menggunakan teknologi polymerase chain reaction (PCR), teknisi laboratorium dapat mengurutkan (atau "memetakan") genetika virus menggunakan berbagai teknologi deteksi mutasi.
Mutasi ini (atau akumulasi mutasi) ditafsirkan oleh teknisi yang menganalisis hubungan antara mutasi yang teridentifikasi dan kerentanan virus yang diharapkan terhadap obat antiretroviral yang berbeda. Database online dapat membantu dengan membandingkan urutan pengujian dengan prototipe virus "tipe liar" (yaitu, HIV yang tidak mengandung mutasi yang resistan).
Interpretasi dari tes-tes ini digunakan untuk menentukan kerentanan obat, dengan semakin banyak jumlah mutasi kunci yang menyebabkan tingkat resistensi obat yang lebih tinggi.
Menjelaskan Phenoytyping HIV
Fenotipe HIV menilai pertumbuhan HIV seseorang dengan adanya obat, kemudian membandingkannya dengan pertumbuhan virus tipe liar kontrol dalam obat yang sama.
Seperti tes genotipe, tes fenotipik memperkuat daerah gag-pol dari genom HIV. Bagian kode genetik ini kemudian "dicangkokkan" ke klon tipe liar menggunakan teknologi DNA rekombinan. Virus rekombinan yang dihasilkan digunakan untuk menginfeksi sel mamalia secara in vitro (di laboratorium).
Sampel virus kemudian terpajan pada peningkatan konsentrasi obat antiretroviral yang berbeda sampai 50% dan 90% penekanan virus tercapai. Konsentrasi tersebut kemudian dibandingkan dengan hasil dari kontrol, sampel tipe liar.
Perubahan "lipatan" relatif memberikan rentang nilai yang menentukan kerentanan obat. Perubahan empat kali lipat berarti bahwa empat kali jumlah obat yang dibutuhkan untuk mencapai penekanan virus dibandingkan dengan tipe liar. Semakin besar nilai lipatannya, semakin tidak rentan virus terhadap obat tertentu.
Nilai-nilai ini kemudian ditempatkan dalam rentang klinis-rendah dan klinis-atas, dengan nilai-nilai yang lebih tinggi menunjukkan tingkat resistensi obat yang lebih tinggi.
Kapan Tes Resistensi Genetik Dilakukan?
Di A.S., pengujian resistensi genetik secara tradisional dilakukan pada pasien yang naif pengobatan untuk menentukan apakah mereka memiliki resistensi obat yang "didapat". Penelitian di A.S. menunjukkan bahwa antara 6% dan 16% virus yang ditularkan akan resisten terhadap setidaknya satu obat antiretroviral, sementara hampir 5% akan resisten terhadap lebih dari satu kelas obat.
Tes resistensi genetik juga digunakan ketika resistensi obat dicurigai pada individu yang menjalani terapi. Tes dilakukan saat pasien menggunakan rejimen yang gagal atau dalam empat minggu setelah penghentian pengobatan jika viral load lebih dari 500. Pengujian genotipe umumnya lebih disukai dalam hal ini karena biayanya lebih murah, waktu penyelesaiannya lebih cepat, dan menawarkan sensitivitas yang lebih besar untuk mendeteksi campuran virus tipe liar dan resisten.
Kombinasi pengujian fenotipik dan genotipe umumnya lebih disukai untuk orang dengan resistansi multi-obat yang kompleks, terutama bagi mereka yang terpajan pada protease inhibitor.